Ich glaube, ich habe es bei einem anderen mal mit dem selben Problem zu tun gehabt. Jemand konnte sich unter keinen Umständen einer manuellen Konfiguration mehr mit seinem Router verbinden. Es wäre möglich, dass die Änderung des Kanals den Fehler verursacht... Ich weiß allerdings nicht, inwiefern dein Router vielleicht in bestimmten Intervallen einen Reset durchführt oder inaktive Verbindungen trennt. Und dein 3DS nicht darauf klar kommt, sich wieder zu verbinden.
Dennoch würde ich vorschlagen, falls dein Router es unterstützt, den 3DS per WPS zu verbinden. In dem Falle muss nur ein bestimmter Knopf am Router betätigt und schließlich eine WPS-Suche vom 3DS aus gestartet werden. Hat einen Kollegen damals weitergeholfen, als er sich plötzlich nicht mehr manuell verbinden konnte.